Le fonctionnement en réseau est une culture d’action horizontale, participative et démocratique. Les acteurs de l’éducation à l’environnement dans les territoires ont choisi cette forme de structuration pour répondre à leurs besoins d’échanges, de mutualisation et d’action collective.

Cette culture se traduit par un fonctionnement le plus souvent en « commissions », « comités de pilotage » et « groupes de travail », composés des membres du réseau. Ces instances sont chargées de la conception et de la réalisation de projets sous la supervision du conseil d’administration. Ce système se caractérise donc par un équilibre dynamique, où chaque structure s’implique dans les projets correspondant à son échelle de territoire. Chaque réseau organise son action à sa propre manière.